Sekwencjonowanie następnej generacji (next-generation sequencing, NGS) zrewolucjonizowało możliwości analizy ekspresji genów. RNA-seq (RNA sequencing), nazywane czasem również fragmentowym sekwencjonowaniem całego transkryptomu (whole-transcriptome shotgun sequencing, WTSS), wykorzystuje NGS do analizy ilości RNA w próbce. RNA-seq oferuje więcej możliwości analizy RNA niż starsze technologie takie jak np. mikromacierze RNA.
W prezentacji omówione zostaną podstawy technologii RNA-seq oraz główne cechy generowanych przez nie danych. Następnie przedstawiony zostanie nowy, hierarchiczny model do analizy danych RNA-seq uzyskanych dla zależnych (np. parowanych) próbek biologicznych. Podstawą konstrukcji modelu jest wielowymiarowy rozkład ujemny‑dwumianowy z efektami losowymi. Przedstawione zostaną badania symulacyjne modelu, jak również wyniki jego zastosowania do analizy rzeczywistych danych RNA-seq.